Sein Interesse für Kinderkardiologie und Pädiatrische Intensivmedizin führte Christian Apitz nach der Facharztausbildung in Würzburg 2003 zunächst an die Universitätsklinik für Kinder- und Jugendmedizin Tübingen. Von 2008 bis 2009 absolvierte der Mediziner ein „Clinical Research Fellowship“ am renommierten Hospital for Sick Children im kanadischen Toronto, nach dem Boston Children's Hospital das weltweit zweitgrößte pädiatrische Forschungskrankenhaus. Im Anschluss wechselte er an das Kinderherzzentrum der Justus-Liebig-Universität Gießen und leitete hier bis zu seinem Wechsel nach Ulm die kinderkardiologische Ambulanz und die Spezialambulanz für Kinder und Jugendliche mit Lungenhochdruck. Christian Apitz verfügt über das EMAH-Zertifikat zur Behandlung Erwachsener mit angeborenen Herzfehlern.