Harald Kaemmerer studierte zunächst Veterinärmedizin und begann nach der Promotion als Tierarzt sein Medizinstudium an der Medizinischen Hochschule Hannover. Auf seine Promotion als Humanmediziner und die Facharztausbildung zum Internisten folgte die Facharztausbildung zum Kardiologen. Der auf Erwachsene mit angeborenen Herzfehlern spezialisierte Mediziner ist seit 2000 Oberarzt der Klinik für Kinderkardiologie und angeborene Herzfehler am Deutschen Herzzentrum München. Harald Kaemmerer ist Mitglied der DGK sowie der European Society of Cardiology (ESC), der Association for European Paediatric Cardiology (AEPC) und der Internationalen Gesellschaft für Erwachsenen-Angeborene Herzkrankheiten (ISACHD). Harald Kaemmerer gehörte der Taskforce für Leitlinien zu Erwachsenen mit angeborenen Herzfehlern der deutschen kardiologischen Fachgesellschaften DGK, DGPK und DGTHG an, die 2007 gemeinsam mit dem Kompetenznetz Angeborene Herzfehler Empfehlungen zum Erwerb einer entsprechenden Zusatzqualifikation für Kinderkardiologen und Kardiologen herausgab.